Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms