Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ATRQ13535 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
ATRQ13535 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ATRQ13535 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
ATRQ13535 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ATRQ13535 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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