Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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