Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATMQ13315 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATMQ13315 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ATMQ13315 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ATMQ13315 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATMQ13315 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATMQ13315 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATMQ13315 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ATMQ13315 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATMQ13315 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATMQ13315 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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