Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NME3Q13232 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NME3Q13232 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NME3Q13232 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms