Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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KCNMA1Q12791 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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KCNMA1Q12791 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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KCNMA1Q12791 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
KCNMA1Q12791 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
KCNMA1Q12791 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
KCNMA1Q12791 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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KCNMA1Q12791 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
KCNMA1Q12791 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
KCNMA1Q12791 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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KCNMA1Q12791 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
KCNMA1Q12791 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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KCNMA1Q12791 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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KCNMA1Q12791 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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KCNMA1Q12791 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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KCNMA1Q12791 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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KCNMA1Q12791 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KCNMA1Q12791 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KCNMA1Q12791 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNMA1Q12791 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KCNMA1Q12791 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNMA1Q12791 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNMA1Q12791 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNMA1Q12791 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KCNMA1Q12791 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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