Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RBBP4Q09028 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RBBP4Q09028 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms