Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD10P28358 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD10P28358 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD10P28358 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD10P28358 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD10P28358 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD10P28358 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD10P28358 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD10P28358 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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