Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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ZBED3Q96IU2 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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ZBED3Q96IU2 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
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ZBED3Q96IU2 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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ZBED3Q96IU2 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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ZBED3Q96IU2 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZBED3Q96IU2 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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