Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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SGF29Q96ES7 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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SGF29Q96ES7 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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SGF29Q96ES7 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGF29Q96ES7 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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SGF29Q96ES7 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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SGF29Q96ES7 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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SGF29Q96ES7 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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SGF29Q96ES7 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGF29Q96ES7 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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