Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRUQ92729 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms