Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms