Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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SGCAQ16586 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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SGCAQ16586 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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SGCAQ16586 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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SGCAQ16586 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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SGCAQ16586 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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SGCAQ16586 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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SGCAQ16586 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
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SGCAQ16586 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCAQ16586 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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