Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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DDB1Q16531 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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DDB1Q16531 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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DDB1Q16531 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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DDB1Q16531 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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DDB1Q16531 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDB1Q16531 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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