Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms