| CCDC6 | Q16204 | MIR607-201 | ENST00000385241 | 96 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-837P-201 | ENST00000391056 | 108 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | FGF7P8-201 | ENST00000402994 | 292 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | EEF1A1P40-201 | ENST00000412883 | 573 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | UBE2FP1-201 | ENST00000416536 | 447 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | ELOCP4-201 | ENST00000420090 | 333 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RBM6-203 | ENST00000421682 | 684 nt | TSL 2 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC018630.2-202 | ENST00000422992 | 927 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL033539.1-201 | ENST00000427775 | 743 nt | TSL 3 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | ELOCP23-201 | ENST00000452014 | 332 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC104308.1-201 | ENST00000454621 | 333 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC096666.1-201 | ENST00000454965 | 348 nt | TSL 3 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | SIDT1-AS1-201 | ENST00000462180 | 465 nt | TSL 3 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC008652.1-201 | ENST00000505261 | 469 nt | TSL 3 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | HMGB1P29-201 | ENST00000505659 | 499 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC104304.1-201 | ENST00000505797 | 291 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
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| CCDC6 | Q16204 | AC005920.2-201 | ENST00000509833 | 332 nt | TSL 3 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RN7SKP43-201 | ENST00000516173 | 320 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Y_RNA.673-201 | ENST00000516306 | 88 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | SNORA31.20-201 | ENST00000517111 | 133 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | LINC00824-201 | ENST00000517583 | 805 nt | TSL 5 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC021736.1-201 | ENST00000521143 | 563 nt | TSL 4 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AP004371.1-201 | ENST00000525240 | 214 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
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| CCDC6 | Q16204 | AC007621.1-201 | ENST00000604544 | 437 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL133255.1-201 | ENST00000606374 | 441 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL354950.2-201 | ENST00000617939 | 290 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL596245.1-201 | ENST00000618994 | 362 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Hammerhead_HH10.1-201 | ENST00000620658 | 125 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | CDK1-201 | ENST00000316629 | 1733 nt | TSL 5 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC000403.1-201 | ENST00000613696 | 3585 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MUM1L1-203 | ENST00000372552 | 3957 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | TFEC-202 | ENST00000320239 | 6605 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | TMPRSS11A-202 | ENST00000508048 | 3247 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | ZNF676-201 | ENST00000397121 | 2944 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | DEFB125-201 | ENST00000382410 | 587 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-606P-201 | ENST00000384721 | 111 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | U3.20-201 | ENST00000390909 | 217 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-516P-201 | ENST00000411381 | 104 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC010731.3-201 | ENST00000415029 | 566 nt | TSL 4 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL359195.1-201 | ENST00000416657 | 339 nt | TSL 3 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC104688.1-201 | ENST00000447158 | 419 nt | TSL 3 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC091179.1-201 | ENST00000461606 | 579 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC117386.2-202 | ENST00000472821 | 522 nt | TSL 3 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC233702.1-201 | ENST00000482905 | 502 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC079382.1-201 | ENST00000493346 | 557 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC145146.2-202 | ENST00000508118 | 326 nt | TSL 3 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | PANCR-202 | ENST00000513690 | 448 nt | TSL 2 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RN7SKP272-201 | ENST00000516988 | 232 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-1073P-201 | ENST00000517182 | 106 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | BTF3P12-201 | ENST00000519620 | 469 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC007536.1-201 | ENST00000533382 | 349 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | LINC02305-201 | ENST00000554142 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | OR4T1P-201 | ENST00000554933 | 911 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL352955.1-201 | ENST00000555490 | 332 nt | TSL 3 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | PWRN1-205 | ENST00000565295 | 465 nt | TSL 3 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | UBE2L4-201 | ENST00000587688 | 464 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL022099.1-201 | ENST00000604551 | 712 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL158801.5-201 | ENST00000623123 | 465 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | FOXP2-211 | ENST00000408937 | 6443 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | PRKAA2-201 | ENST00000371244 | 9347 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | NXPE1-204 | ENST00000536271 | 2289 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | POLK-217 | ENST00000515295 | 1438 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | ISPD-AS1-202 | ENST00000438573 | 2252 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Y_RNA.67-201 | ENST00000362870 | 100 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Y_RNA.142-201 | ENST00000363491 | 102 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU5E-8P-201 | ENST00000363502 | 116 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | SNORA69-201 | ENST00000383895 | 132 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | SNORA7.4-201 | ENST00000384249 | 137 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-39P-201 | ENST00000384344 | 107 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Y_RNA.509-201 | ENST00000384506 | 99 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Y_RNA.535-201 | ENST00000384612 | 99 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | TRAJ32-201 | ENST00000390505 | 66 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | SNORD67-201 | ENST00000390833 | 111 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-278P-201 | ENST00000390945 | 109 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-332P-201 | ENST00000391193 | 108 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RPL23AP32-201 | ENST00000395315 | 459 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | ZNF90P2-204 | ENST00000419323 | 1075 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL137014.1-201 | ENST00000420490 | 1226 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC003685.2-201 | ENST00000422795 | 395 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MTCYBP8-201 | ENST00000422855 | 651 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RPL21P112-201 | ENST00000434403 | 463 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AL135938.1-201 | ENST00000443141 | 297 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC007677.1-201 | ENST00000445757 | 515 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | NRG3-AS1-201 | ENST00000448936 | 555 nt | TSL 2 BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | BCL2L15-204 | ENST00000471267 | 267 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AP000852.1-201 | ENST00000472460 | 573 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RPS20P22-201 | ENST00000473700 | 357 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AP004217.1-201 | ENST00000480579 | 346 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC105343.1-201 | ENST00000505586 | 358 nt | TSL 3 BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC008539.1-201 | ENST00000507653 | 482 nt | TSL 3 BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MTND3P22-201 | ENST00000510932 | 243 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-1038P-201 | ENST00000516516 | 104 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |