Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
VAMP3Q15836 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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