Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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