Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SYCP1Q15431 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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SYCP1Q15431 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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SYCP1Q15431 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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SYCP1Q15431 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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SYCP1Q15431 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
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SYCP1Q15431 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SYCP1Q15431 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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