Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NR6A1Q15406 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR6A1Q15406 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms