Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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