Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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NKX1-1Q15270 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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NKX1-1Q15270 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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NKX1-1Q15270 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NKX1-1Q15270 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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