Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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PDK3Q15120 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PDK3Q15120 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PDK3Q15120 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PDK3Q15120 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDK3Q15120 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PDK3Q15120 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PDK3Q15120 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PDK3Q15120 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDK3Q15120 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PDK3Q15120 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDK3Q15120 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDK3Q15120 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDK3Q15120 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDK3Q15120 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDK3Q15120 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDK3Q15120 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDK3Q15120 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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