Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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BRD3Q15059 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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BRD3Q15059 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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BRD3Q15059 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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BRD3Q15059 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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BRD3Q15059 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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BRD3Q15059 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
BRD3Q15059 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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