Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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SHPRHQ149N8 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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SHPRHQ149N8 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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SHPRHQ149N8 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SHPRHQ149N8 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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