Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RAB39AQ14964 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.2 ms