Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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