Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NEDD9Q14511 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms