Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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