Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CKAP5Q14008 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CKAP5Q14008 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CKAP5Q14008 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CKAP5Q14008 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CKAP5Q14008 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CKAP5Q14008 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CKAP5Q14008 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CKAP5Q14008 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CKAP5Q14008 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CKAP5Q14008 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CKAP5Q14008 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CKAP5Q14008 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CKAP5Q14008 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CKAP5Q14008 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CKAP5Q14008 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CKAP5Q14008 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
CKAP5Q14008 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CKAP5Q14008 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CKAP5Q14008 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CKAP5Q14008 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CKAP5Q14008 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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CKAP5Q14008 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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CKAP5Q14008 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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