Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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CUL4AQ13619 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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CUL4AQ13619 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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CUL4AQ13619 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CUL4AQ13619 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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