Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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TCIRG1Q13488 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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TCIRG1Q13488 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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TCIRG1Q13488 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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TCIRG1Q13488 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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TCIRG1Q13488 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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