Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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TOP3AQ13472 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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TOP3AQ13472 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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TOP3AQ13472 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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TOP3AQ13472 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TOP3AQ13472 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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