Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTGDRQ13258 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms