Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIN2BQ13224 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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