Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXF2Q12947 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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