Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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PGGT1BP53609 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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PGGT1BP53609 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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