Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRGP23470 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRGP23470 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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