Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
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PTPRCP08575 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.89
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PTPRCP08575 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
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PTPRCP08575 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRCP08575 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
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