Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HTATSF1O43719 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HTATSF1O43719 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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