Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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