Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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