Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TIMMDC1Q9NPL8 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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