Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.9 ms