Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FAM3DQ96BQ1 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms