Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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