Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PXDC1Q5TGL8 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130 ms