Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC064874.1-201ENST00000409661 441 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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ANKRD39Q53RE8 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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ANKRD39Q53RE8 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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ANKRD39Q53RE8 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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ANKRD39Q53RE8 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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ANKRD39Q53RE8 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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ANKRD39Q53RE8 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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ANKRD39Q53RE8 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC092066.1-201ENST00000425131 317 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC016396.1-201ENST00000440189 328 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
ANKRD39Q53RE8 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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