Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
C4orf17Q53FE4 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms