Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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CCDC142Q17RM4 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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CCDC142Q17RM4 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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