Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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HIF1AQ16665 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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HIF1AQ16665 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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HIF1AQ16665 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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HIF1AQ16665 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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HIF1AQ16665 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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HIF1AQ16665 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HIF1AQ16665 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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